Манускрипт ниндзя (яп. 獣兵衛忍風帖 дзю:бэй нинпу:тё:) — полнометражный аниме-фильм в жанре исторического самурайского боевика — сэйнэн, снятый студией «Animate Film» при содействии студии «Madhouse» в 1993 году (западный релиз — 1996 г.). Главный герой — бродячий самурай-ниндзя Дзюбэй Кибагами, прототипом для которого послужил герой самурайского эпоса и реальная историческая личность Ягю Дзюбэй. «Манускрипт ниндзя» — один из самых значимых фильмов в истории японской анимации, классика исторического и мистического аниме. Отличительными особенностями картины являются филигранная отточенность сюжета и одновременно натуралистичность и жестокость. В 1993 г. фильм получил награду «Citizen’s Award» на Международном фестивале фантастических фильмов в Юбари.
В 2003 году снят телесериал-сиквел «Манускрипт ниндзя: новая глава».
Так же существует еще один фильм о похождениях легендарного самурая Дзюбее, созданный режиссером Урата Ясунори при содействии студии ADV Films — «Воскрешение ниндзя».